Admis à l'école spéciale militaire de Saint Cyr en 1982, il choisit à l'issue de sa scolarité de servir dans l'arme blindée cavalerie et rejoint l'école d'application de son arme à Saumur. Entre 1986 et 2006, il alterne les responsabilités en régiment : chef de peloton de chars AMX30 au 2e régiment de Chasseurs à Verdun dans la Meuse, capitaine commandant l'escadron expérimental Leclerc au 503e régiment de chars de combat de Mourmelon dans la Marne, chef de corps du 6-12e régiment de Cuirassiers équipé de chars Leclerc à Olivet dans le Loiret. En octobre 2005, il commande pendant 5 mois le groupement tactique interarmes 1 (GTIA 1) à Bouaké en Côte d’Ivoire dans le cadre de l'opération LICORNE. Il sert également une douzaine d'années à Paris à la section technique de l'armée de Terre, à l'état-major de l'armée de Terre, à l'inspection de l'armée de Terre à l'état-major des armées. De septembre 2008 à juin 2009, il est auditeur de la 44e session du centre des hautes études de l'armement (CHEAr). Le 1er août 2013, il est promu général de brigade et nommé directeur de la section technique de l'armée de Terre avant de devenir sous-chef d'état-major Plans Programmes et général de division. Le général Charles BEAUDOUIN est officier de la légion d'honneur et officier de l'ordre national du mérite. Il est titulaire de la croix de la valeur militaire et de la médaille du courage et du dévouement. Il est marié et père de deux enfants.