Responsable informatique et responsable sécurité des systèmes d'information de Thomson-CSF instrumentation services de 1999 à 2005, puis chargée de mission au sein de la mission sécurité de l'agence pour le développement de l'administration électronique (ADAE) – services du Premier ministre, Florence ESSELIN a contribué à l'élaboration des référentiels et décrets concernant la sécurité, l'interopérabilité et l'accessibilité des échanges entre les autorités administratives et leurs usagers. Rejoignant le secrétariat général de la défense et de la sécurité nationale (SGDSN) en 2006 en tant qu'inspecteur DCSSI, elle enseigne au CFSSI les fondamentaux de la confiance numérique et la méthode EBIOS et apporte conseil aux ministères, aux collectivités territoriales et à quelques organismes d'importance vitale pendant plus de 10 ans ; elle participe ainsi à la création et à l'essor de l'agence nationale de la sécurité des systèmes d'information (ANSSI). Parallèlement, pendant cinq ans elle intervient au profit du comité français d'accrédiation (COFRAC) en tant qu'évaluateur technique, responsable d’évaluation qualifiée pour les domaines de la certification des auditeurs, des responsables d’audits et des responsables d’implémentation des systèmes de management de la sécurité de l’information (SMSI) suivant la norme ISO 27001, la certification de personnes dans le domaine de la gestion des risques en sécurité de l’information (ISO 27005) et la certification des prestataires de services de confiance suivant la norme NF EN ISO/CEI 17021.

Fin 2016, elle rejoint le service du Haut fonctionnaire de défense et de sécurité au cabinet de la ministre de la culture en tant que haut fonctionnaire adjoint de défense et de sécurité, fonctionnaire de sécurité des systèmes d'information.

Depuis l'été 2018 la mission numérique de la gendarmerie nationale, attachée au cabinet du directeur général de la gendarmerie nationale, fait appel à ses compétences pour contribuer à élaborer et animer la stratégie numérique et de lutte contre les cybermenaces de la gendarmerie nationale et pour en animer les réseaux de réservistes numériques et "cyber" - dont Florence ESSELIN est membre depuis décembre 2012 au grade de lieutenant-colonel.

Elle est également membre du CESIN et expert à titre individuel du Club EBIOS.